安徽中医药高等专科学校前身是始建于1960年的“芜湖市中医学校”。2001年，学校独立升格并于次年经教育部批准，在全国同类院校率先更名为“安徽中医药高等专科学校”。为整合卫生教育资源，壮大学校实力，2006年，市政府将芜湖市中医医院成建制划归学校作为直属附属医院;2012年，附属市牙病防治所成功创建附属口腔医院(芜湖市口腔医院)。经过50多年的建设与发展，学校已经成为具有鲜明中医药特色的地方性高等院校，2010年，学校成功创建了“安徽省示范性高等职业院校”;2015年，学校在省级示范性高职院校项目验收和人才培养工作个性化评估中获得“优秀”等次。
学校现为教育部中医药职业教育教学指导委员会副主任委员单位、全国中医药职业技术教育学会理事长单位、中华中医药学会治未病分会副主任委员单位、世界中医药学会联合会亚健康专业委员会、药膳食疗研究专业委员会副会长单位、安徽省中医药现代化研究会理事长单位。
学校占地面积997亩，总建筑面积29.7万平方米，现有医疗系、药学系、康复保健系、护理系、口腔医学系及基础教学部、思想政治理论课教学研究部等教学系部，开办中医学、中医骨伤、针灸推拿、中药学、药学、护理、中医健康管理、中医养生保健(含中医养生旅游方向)、医疗美容技术、口腔技术、康复治疗技术等29个专科专业及专业方向，学校现有专任教师553人，其中，副高以上专业技术人员192人，具有研究生学历人员246人，省级优秀教师3人，学校还聘任国医大师李济仁、长江学者叶文才为特聘教授、客座教授。
学校下辖2所直属附属医院、1个安徽中药资源研究所、1个天然药用植物园和9所非直属附属医院及稳定的实习基地120家。学校附属中医医院(芜湖市中医医院)创立于1958年，在中医界素有“江南中医一枝花”的美誉，为“全国首批示范中医院”、“国家三级甲等中医医院”，医院拥有4个国家级重点专科，6个省级重点专科,7个市级重点专科，1个省级重点专病，国家级名老中医工作室4个，省级名老中医工作室4个。
学校现有中央财政支持实训基地1个，中央财政支持提升专业服务产业发展能力项目2个，省级特色专业、骨干专业、示范专业、专业综合改革试点项目15个，省级精品课程、精品开放课程16门，省级示范实验实训中心、创新实验区、校企合作实践教育基地、校企共建生产性实训基地12个，省级教学团队7个，省级教学名师、教坛新秀、优秀教学管理工作者24人，省级卓越技能型人才计划2项，省级示范实习实训中心1个、省级实习实训基地1个。
近年来，学校共承担了各类科学研究项目97项，其中市厅级以上科研项目49项，获得7项国家授权专利;公开发表学术论文248篇，其中核心期刊类论文37篇。承担各级各类教学研究项目105项，其中省级以上63项;获各级获得各级各类教学成果奖57项，其中省级25项。近五年，学校教师主编教材58部，其中2部教材入选教育部普通高等教育精品教材。2013年，学校共有15名主编、23名副主编参与第三轮全国中医药高职高专国家卫计委规划教材编写、修订。学校主办的《现代中药研究与实践》为中国科技核心期刊，是我国中药研究领域的重要学术期刊之一。
建校50余年来，特别是升格近15年来，学校秉承“厚德、博学、济世、日新”的校训，坚持“以人为本、尚德重技，创新服务，特色发展”的办学理念，在中医药专业建设、应用型人才培养、中医药对外交流、中医药健康产业研发以及服务地方经济和社会发展等方面，形成了独特的优势，为国家培养了5万余名中医药应用型人才。当前，学校正进一步解放思想，同心同德，抢抓机遇，科学发展，努力提高人才培养质量和提升办学层次。
